Dit stripverhaal is gebaseerd op de Pokémon games en begint bij het allereerste begin: een jonge hoofdrolspeler – Red – gaat eropuit in een wereld die wordt bevolkt door wonderlijke wezens, Pokémon! Je ziet hoe Red nieuwe vrienden maakt die hem tijdens zijn avonturen zullen helpen: Professor Oak, de Gym Leiders Brock en Misty. Je bent erbij als hij voor het eerst Pikachu ontmoet en veel andere, unieke Pokémon die hem vergezellen op zijn reis. En hij kruist het pad van een geheimzinnige groepering met kwade plannen: